Estudos de amplicon e metagenómicos têm demonstrado consistentemente que alimentos fermentados naturalmente (FFs) são reservatórios ricos de diversos microrganismos autóctones com potencial significativo para promover a saúde humana. Para aproveitar esses benefícios, é essencial preservar todo o conjunto de comunidades microbianas vivas em seu estado mais original e inalterado.

Embora várias cepas de bactérias lácticas, bactérias acéticas e leveduras tenham sido isoladas de FFs, grande parte da diversidade microbiana nesses alimentos ainda permanece inexplorada. A maioria dos probióticos comerciais derivados de FFs continua a concentrar-se numa estreita faixa de táxons, principalmente devido à ampla dependência de métodos clássicos de cultivo. No entanto, estudos emergentes que adotaram a culturómica no contexto de FFs demonstram uma melhoria substancial na recuperação de diversas cepas microbianas. Embora essa abordagem seja muito promissora, sua aplicação deve ser realizada com cautela, particularmente no que diz respeito à segurança de cepas recém-isoladas e seu potencial para abrigar ou transmitir genes de resistência a antibióticos. Além disso, embora o perfil de cepas baseado em ómicas comece a ganhar força, a maioria das avaliações de probióticos na literatura revista permanece restrita a análises não moleculares in vitro.

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Fonte: ScienceDirect

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